- 外传Reboot：百夜Z=1人类的支援
- Z=2丢鹌鹑蛋
- Z=3请给我宇宙
- Z=4话归地球母亲的怀抱
- Z=5等待百夜的过程也是忙碌的
- Z=6为了保护ISS，我要出征去狩猎
- Z=7我看到你了
- Z=8没有灰色的时间
- Z=9我在这里
- 1Z=1STONEWORLD
- 2Z=2FANTASYVSSCIENCE
- 3Z=3KINGOFTHESTONEWORLD
- 4Z=4纯白的贝克
- 5Z=5杠
- 6Z=6大树VS司
- 7Z=7火药的冒险
- 8Z=8燃起狼烟
- 9Z=9千空VS司
- 10Z=10科学之徒
- 11Z=11科学的武器
- 12Z=12序章最终话
- 13Z=13第一话
- 14Z=14信仰
- 15Z=15石之世界的两个国家
- 16Z=16琥珀
- 17Z=17可怕的表情
- 18Z=18妖术决战
- 19Z=19200万年之所在
- 20Z=20STONEROAD
- 21Z=21铁的黎明
- 22Z=22SURVIVALGOURMET
- 23Z=23轻浮之人
- 24Z=24电光火石
- 25Z=25手中捧起科学的明灯
- 番外番外1
- 26Z=26肤浅的同盟
- 27Z=27某科学者的愿望
- 28Z=28CLEARWORLD
- 29Z=29SENKU'SLAB
- 30Z=30DEATHGREEN
- 31Z=31背道而驰的伙伴
- 32Z=32BRAIN&HEAT
- 33Z=33不得了的药
- 34Z=34以智克敌的御前比武
- 35Z=35假面骑士
- 36Z=36金狼与银狼
- 37Z=37科学家克罗姆
- 38Z=38MASTEROFFLAME
- 39Z=39ANDTHEWINNERIS
- 40Z=40200万年的结晶
- 41Z=41DOCTORSTONE
- 42Z=42数千年的传说
- 43Z=43人类最后的6人
- 44Z=44百夜与千空
- 45Z=45第一话最终话
- 46Z=46STONEWARS
- 47Z=47SCIENCEVS.POWER
- 48Z=48科学之刃
- 49Z=49向现代进发
- 50Z=50人类最强的武器
- 51Z=51石之世界的甜品
- 52Z=52动力时代
- 53Z=53斯巴达制造俱乐部
- 54Z=54闪耀的蓝宝石
- 55Z=55TREASUREDUNGEON
- 56Z=56THETREASURE
- 57Z=57HEATHEART
- 58Z=58科学的电波
- 59Z=59声音传向无限远方
- 60Z=60天女的歌声与恶魔的低语
- 61Z=61STONEWARSBEGINNING
- 62Z=62DOUBLECHASE
- 63Z=63情报战争
- 64Z=64HOTLINE
- 65Z=65来自死者的电话
- 66Z=66说谎的人、诚实的人
- 67Z=67全军出击
- 68Z=68革命之火
- 69Z=69STEAMGORILLA
- 70Z=70PAPERSHIELD
- 71Z=71PRISONBREAK
- 72Z=72经验值
- 73Z=73绝密任务
- 74Z=74决定命运的20秒
- 75Z=75COUNTDOWN20
- 76Z=76FINALBATTLE
- 77Z=77科学的力量
- 78Z=78破坏之物，解救之物
- 79Z=79一直等待这一刻
- 80Z=80人类最强二人组合
- 81Z=81FINGERTIP
- 82Z=82EPILOGUEOFSTONEWARS
- 83Z=83Dr.STONE
- 84Z=84人=力
- 85Z=85资源的帝王
- 86Z=86MONEY
- 87Z=87千空百货
- 88Z=88人类的翅膀
- 89Z=89冒险者们
- 90Z=90NEWWORLDMAP
- 91Z=91没有面包，那就从种小麦开始做
- 92Z=92欲望=正义
- 93Z=93第一张要献给你
- 94Z=94黑色宝石的香气
- 95Z=95FirstContact
- 96Z=96科学之眼
- 97Z=97有趣的帝王学
- 98Z=98龙水
- 99Z=99科学王国相片日记
- 100Z=最初的百物语
- 101Z=101TREASUREBOX
- 102Z=102科学船珀尔修斯
- 103Z=103绝望与希望之光
- 104Z=104科搜研的男人
- 105Z=105岛上第一美少女
- 106Z=106石化的秘密
- 107Z=107王牌就在科学之船上
- 108Z=108两张王牌
- 109Z=109完美逃跑
- 110Z=110美丽的科学
- 111Z=111SCIENCEWARS
- 112Z=112三次元的王者
- 113Z=113暗号通信的科学
- 114Z=114科学，不动声响地穿山裂石
- 115Z=115一秒与一粒
- 116Z=116奇迹在我手中
- 117Z=117反击的科学王国
- 118Z=118SILENTSOLDIERS
- 119Z=119SCIENCESOLDIERS
- 120Z=120TOPSEACRET
- 121Z=121石化光线的真面目
- 122Z=122头脑战的拼图碎片
- 123Z=123头脑战的交换游戏
- 124Z=124神与恶魔的发明
- 125Z=125三次元的决战
- 126三次元的谋略
- 127MEDUSA&PERSEUS
- 128全境大乱战
- 129JOKER
- 130恶魔的选择
- 131穷凶极恶之罪
- 132最强的武器
- 133毁灭之光
- 134主将之战
- 135COUNTING
- 136MEDUSAVSSCIENCE
- 137LASTMANSTANDING
- 138EpilogueofChapter3
- 139FIRSTDREAM
- 140新世界宇航员
- 141FIRSTTEAM
- 142WORLDPOWER
- 143RYUSUIVSSENKU
- 144RYUSUIGENVSSENKUKOHAKU
- 145BARFRANCOIS
- 146BARFRANçOIS~BITTERSIDE~
- 147SCIENCEJOURNEY
- 148地球的开拓者们
- 149黑暗之中的诱蛾灯
- 150正义的科学家
- 151Dr.X
- 152DOCTORVSDOCTOR
- 153WARGAME
- 154SPYVSSPY
- 155SCIENCEISELEGANT
- 156两名科学家
- 157同一时刻同一地点
- 158谁是科学家
- 159LOCKON
- 160科学的明灯
- 161CRAFTWARS
- 162沾满泥土的道路
- 163全世界决战
- 164RE-LOCKON
- 165熟知规则之人与创造规则之人
- 166最强的骑士
- 167兴趣爱好
- 168100万人的玉米都市
- 169RISKorHEART
- 170仰望同一个月亮
- 171看到的是同样的光芒
- 172智慧的路标
- 173EARTHRACE
- 174虚幻的巴拿马运河
- 175横贯南美超级竞速赛
- 176包围网突破战
- 177MEDUSAMECHANISM
- 178科学就是翻越高山
- 179钢索上的羁绊
- 180狰狞却又不失美丽
- 181NEWWORLDSCIENCE
- 182DIAMONDHEART
- 183STONESANCTUARY
- 184美杜莎要塞
- 185美丽的解理面
- 186刃十人十色
- 187CYBERGUERRILLA
- 188曾经试图抹杀之物
- 189OURDr.STONE
- 190科学超越生命
- 191神的呐喊响彻世界
- 192直到再会的那一天
- 193OURSTONEWORLD
- 194孤零零的唯一一个人类
- 195孤零零的寻宝者
- 196孤身一人的科学家
- 197满是石头的伊甸园与禁果
- 198WHOLENEWWORLD
- 199超合金
- 200FUTUREENGINE
- 201MORSETALK
- 202龙水财阀
- 203MISSILEHEART
- 204数学是上帝书写宇宙的文字
- 205创造宇宙的0和1
- 218WorldWideWorkshop
- 219三勇士
- 220想要得到一切
- 221托付一切
- 222SCIENCEROAD
- 2230
- 224INTHESPACE
- 225DOCKING
- 226GIANTSTEP
- 227YOUARE
- 228LIFESTONE
- 229WHYMAN
- 230HUMAN
- 231引人入胜的未来
- 232Dr.STONE
- 短篇TERRAFORMING